地下鉄丸ノ内線・大江戸線本郷三丁目駅の北，徒歩５分。慶長元年（1596年）に京都知恩院より、寺号を附与されるが、開山の時期は明らかではない。 現在の本堂は天保10年（1839年）の建築で、関東大震災や第二次世界大戦で被害を受けることがなく、現在に至っている。 寺の隣に樋口一葉が幼少の頃に住んでいたことがあり、この寺が登場する作品（『ゆく雲』）があることから樋口一葉ゆかりの寺ともいわれる。境内の一角に文京一葉会館がある。
